左紫梅 , 黎斯敏 , 詹若挺 , 何瑞^*

广州中医药大学,中药资源科学与工程研究中心,岭南中药资源教育部重点实验室,国家中成药工程技术研究中心南药研发实验室,广州,510006
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年06月08日    接受日期: 2020年06月19日    发表日期: 2021年12月26日

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本研究克隆青天葵NfD53 基因并分析其序列特征，可为今后深入研究 NfD53蛋白功能及独脚金内酯(SLs)对植物侧枝生长发育的影响提供参考依据。以濒危药用植物青天葵叶片为实验材料，利用 RT-PCR及 RACE技术克隆获得 2条NfD53 基因，分别命名为NfD53-1 和NfD53-2，应用生物信息学软件分析其序列并进行功能预测。结果显示：NfD53-1 基因全长 3 523 bp，编码 974个氨基酸；NfD53-2 全长 3 916 bp，编码 1 190个氨基酸。两者等电点分别为：8.34、6.33；亲水性平均数为：-0.250、-0.263；均为不稳定的亲水性蛋白，无信号肽及切割位点，定位于叶绿体。两蛋白都具有 ClpA超家族核心序列，而 NfD53-1蛋白还具有 ClpC超家族核心序列，并含有 3个非特异性位点(ClpA, ClpC和 AAA_2)，NfD53-2蛋白含有 1个ClpA非特异性位点。蛋白的二级结构中均以无规则卷曲占比最高，分别占 47.16%和 51.21%；其次是α- 螺旋，占 38.70%和 31.69%。系统进化分析表明，NfD53-1与番茄等聚为一支，但氨基酸相似度较低 (20.27 %)，NfD53-2与铁皮石斛聚为一支，同源性较高(66.49%)。本研究为后续进一步探讨该基因的功能及 SLs在植物生长发育中的作用提供数据参考。

青天葵；NfD53；生物信息学分析；RACE技术